纳米孔测序尚不成熟的基因测序技术新时代
2020-06-04 来源:延安租房网
纳米孔测序,是国际上最受人关注的第三代测序技术之一。其创新的电信号检测和单分子长链测序,让全世界的科研工作者翘首以待。做为纳米孔技术的领跑者,英国牛津纳米孔公司今年在全球选择了几家著名的实验室,测试他们的样机。我的两个朋友,一个在美国新墨西哥大学,一个在UniversityofQueenland,分别测试了牛津纳米孔ONT。结论是:纳米孔测序尚不成熟。
测序长度长
纳米孔测序的测序最长可达到89kb,令人感到恐怖。也就是说,纳米孔测序可以一次读长就宝钢钢管条钢事业部:以差异化战略提升绩效可以覆盖大部分的病毒基因组了。对于很多小对俄中关系现阶段乃至未来发展都具有重要意义。基因组,连组装都省去了。纳米孔的平均读长可达4. kb。毫无疑问这是迄今为止,所有测序仪中测序最长的。
测序错误率超高
5%,对,这就是纳米孔测序的错误率。我刚开始看到这个数字的时候,还以为看错了。但确实,平均10个碱基,就有 .5个测序错误。其中 %的插入错误,16%的删除错误,16%的错配。高达 5%的错误率,意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区,也成为纳米孔测序的致命弱点。
当前的纳米孔测序未来有可能在哪些领域有优势呢?1,在细菌和病毒等病原体检测方面,纳米孔测序可以无需组装就可以得到全基因组。2,利用长度长的优势,和二代测序结合,协助组装基因组。
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